L'arabinose est un sucre à cinq carbones que l'on trouve largement dans la nature et peut servir de seule source de carbone dans de nombreuses bactéries. Les produits protéiques de trois gènes (araB, araA et araD) sont nécessaires à la dégradation de l'arabinose chez les membres de la famille des Enterobacteriaceae, tels que E. coli et S.
Qu'est-ce que l'arabinose fait aux bactéries ?
Ainsi, lorsque l'arabinose est présent pour activer l'opéron arabinose, la GFP est produite et la bactérie peut devenir fluorescente. Sans arabinose, le gène GFP n'est pas exprimé et il n'y a pas de fluorescence. Ainsi, en faisant varier la composition des nutriments, un chercheur peut contrôler quand (et si) la floraison se produit dans les bactéries transformées.
Quel est le rôle de l'arabinose dans la transformation bactérienne ?
L'arabinose agit comme un régulateur allostérique de l'AraC, modifiant les sites d'ADN auxquels il se lie et la façon dont il forme un dimère. Rappelez-vous que l'arabinose est le sucre qui est catabolisé par les protéines de l'opéron AraBAD. Lorsque l'arabinose est ajouté à l'environnement dans lequel vit E. coli, il se lie étroitement à l'AraC.
Pourquoi utilise-t-on l'arabinose ?
Utilisation en biologie
En biologie synthétique, l'arabinose est souvent utilisé comme interrupteur unidirectionnel ou réversible pour l'expression des protéines sous le Pmauvaispromoteur dans E. coli. Cet interrupteur peut être annulé par la présence de glucose ou inversé par l'ajout de glucose dans le milieu de culture, ce qui est une forme de répression catabolique.
Commentl'arabinose affecte-t-il la régulation et l'expression des gènes dans les bactéries ?
Lorsque l'arabinose est présent, araC détend la configuration de l'ADN afin que la transcription puisse se produire, mais lorsque ce glucide est absent, la même protéine contraint l'ADN à réduire sa capacité à se lier avec l'ARN polymérase.