En biologie moléculaire, STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) est une base de données biologique et une ressource Web sur les interactions protéine-protéine connues et prédites. … La dernière version 11b contient des informations sur environ 24, 5 millions de protéines provenant de plus de 5000 organismes.
À quoi sert la base de données STRING ?
La base de données STRING a pour objectif de collecter et d'intégrer ces informations, en consolidant les données connues et prédites d'association de protéines–protéines pour un grand nombre d'organismes.
Qu'est-ce qu'un score STRING ?
Dans STRING, chaque interaction protéine-protéine est annotée avec un ou plusieurs "scores". Il est important de noter que ces scores n'indiquent pas la force ou la spécificité de l'interaction. Au lieu de cela, ce sont des indicateurs de confiance, c'est-à-dire la probabilité que STRING juge qu'une interaction est vraie, compte tenu des preuves disponibles.
Pourquoi les protéines interagissent-elles ?
Les interactions protéine-protéine (IPP) sont des contacts physiques de haute spécificité établis entre deux ou plusieurs molécules de protéines à la suite d'événements biochimiques dirigés par des interactions qui incluent des forces électrostatiques, l'hydrogène collage et l'effet hydrophobe.
Qu'est-ce qu'une association fonctionnelle ?
définition. Relation binaire entre entités biologiques lorsque l'une module l'autre en termes de fonction, d'expression, de dégradation ou de stabilité de l'autre et de la relationentre les partenaires ne peut pas être établie comme directe, de sorte que des étapes intermédiaires sont implicitement présentes.
