Puisque la sonication peut potentiellement dégrader les protéines et dénaturer les épitopes protéiques, nous avons ensuite évalué l'impact de la sonication sur l'intégrité des protéines.
La sonication peut-elle endommager les protéines ?
Réponses populaires (1)
Protocole de sonication standard plutôt ne peut pas provoquer la fragmentation des protéines- l'énergie est trop faible. Il ne devrait même pas provoquer sa dénaturation. Il peut être dénaturé lorsque vous le soniquez trop longtemps et que vous surchauffez l'échantillon. Si vous utilisez la chromatographie au nickel, d'autres bandes peuvent être simplement des impuretés.
La sonication peut-elle rompre les liaisons peptidiques ?
La sonication ne peut normalement pas briser la structure primaire d'une protéinecar cette structure (la séquence d'acides aminés) est constituée de liaisons covalentes plusieurs fois plus fortes que les liaisons hydrogène et la sonication peut fournir l'énergie nécessaire pour rompre ces liens.
Est-ce que la sonication brise la membrane nucléaire ?
A une sonication courte à faible énergie peut perturber la membrane plasmique sans casser trop de membranes mitochondriales ou nucléaires cédant au tact des mitochondries.
La sonication est-elle nécessaire pour l'extraction des protéines ?
La solubilisation des détergents (par exemple, SDS) qui est nécessaire pour l'isolement des protéines membranaires entraîne une colle comme le lysat principalement à cause des acides nucléiques. La sonication est donc nécessaire dans de tels cas pour perturber ces acides nucléiques. La sonication génère beaucoup de chaleur et n'est pas bonne pourbeaucoup de protéines.
